1.對植物的危害
土壤中的重金屬會對植物產生一定的毒害作用，引起株高、主根長度、葉面積等一系列生理特征的改變。主要是因為吸收到植物體內的重金屬能誘導其體內產生某些對酶和代謝具有毒害作用和不利影響的物質，如H2O2、C2H2等類物質。重金屬的脅迫有時會引起大量營養的缺乏和酶有效性的降低，較高濃度的重金屬含量有抑制植物體對Ca、Mg等礦物質元素的吸收和轉運的能力。
經過Cd處理的小麥幼苗葉和根的生長明顯受到抑制，其莖和葉中富集的Cd量增加，Fe、Mg、Ca和K等營養元素的含量下降。對廣州市農業用水的狀況與蔬菜產品的質量進行了深入的分析研究，得出長期使用富含重金屬的污水灌溉菜田，各種蔬菜都會受到不同程度的污染。土壤重金屬污染影響植物生理生態過程、植物產量和品質，如廣水城郊由于耕地土壤受到重金屬污染，不同農作物中的Cu、Pb、Zn、Cd檢測結果全部或部分重金屬超標。
重金屬污染脅迫可以危害植物的根系，造成根系生理代謝失調，生長受到抑制，反過來，受害根系的吸收能力減弱，導致植物體營養虧缺。
2.對土壤動物的危害
隨著各種重金屬元素在土壤中的富集，對土壤動物的生存繁衍帶來了嚴重威脅。研究了淮南市重金屬污染對土壤動物群落和多樣性影響，得出重金屬污染不同程度地對土壤動物構成危害，土壤動物群落的組成與數量隨著污染的加重而減少，在重污染的土壤中，優勢類群與常見類群的種類明顯減少;重金屬對土壤動物群落的多樣性指數、均勻性指數、密度類群指數都有減少的趨勢。土壤重金屬含量對蚯蚓、線蟲等無脊椎動物數目、豐富度、生物數量和群體構成等有直接影響。
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